Passaram apenas duas semanas desde o lançamento da versão 3.0 do iPhoneOS e a Apple já tem uma nova versão disponível embora seja destinada a um grupo muito restrito.
O iPhoneOS 3.1 está disponível enquanto sistema de desenvolvimento (SDK) e conta com um conjunto de novas funcionalidades que podem ser aproveitadas desde já pelos programadores para criarem aplicações mais ricas.

A par das inevitáveis correcções de erros, há também várias melhorias e novidades bem interessantes.

• Na edição de vídeos é possível conservar o original,
• O comando por voz funciona através de auriculares Bluetooth,
• O iPhone vibra quando se arrastam ícones,
• Os módulos Quartz e OpenGL foram melhorados,
• O firmware do modem foi actualizado,
• Pode-se editar vídeos com aplicações criadas por terceiros,
• As notificações de calendário apresentam também o local,

Mais uma vez ficam de fora de uma destas actualizações pontos considerados chave pelos utilizadores, como a resolução para o problema de sobre-aquecimento detectados em diversos iPhones ou a correcção de uma alegada falha de segurança no sistema de mensagens de texto (SMS).